Tijekom cijele godine u arboretumu, staklenicima i rasadnicima skuplja se sjeme zeljastih jednoljetnica i trajnica te drvenastih biljaka. Dio sjemena namijenjen je potrebama Vrta; svake godine, krajem zime, siju se brojne sorte različitih vrsta jednoljetnica koje će se u proljeće saditi na parteru i uz jezerca. Zbirka trajnica obnavlja se iz sabranog sjemena ili reznica.
Sjeme sabiru i stručni suradnici tijekom terenskih istraživanja svake godine. Većina sjemena se pohranjuje u papirnate vrećice te na police u prostorijama sjemenarne, a osjetljivije i rijetko sjeme na +4C° (u hladnjacima). U budućnosti planiramo modernizaciju sjemenarne i osnivanje banke sjemena.
 

Najveći dio sjemena služi za razmjenu s ostalim botaničkim vrtovima u svijetu. Putem takve nekomercijalne razmjene zbirke botaničkih vrtova stalno se obogaćuju i rastu. Već desetljećima razmjenjujemo sjeme s tristotinjak vrtova i arboretuma.
U tu svrhu svake godine sastavljamo popis sjemena za razmjenu, tzv. Delectus seminum koji je dostupan u tiskanom obliku ili on-line (PDF). Sjeme šaljemo isključivo botaničkim vrtovima i znanstvenim institucijama, ne privatnim osobama !